Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LRRC38Q5VT99 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC38Q5VT99 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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LRRC38Q5VT99 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC38Q5VT99 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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