Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RPRD2Q5VT52 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms