Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD1Q5SYB0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms