Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM74A1Q5RGS3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM74A1Q5RGS3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms