Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A3Q5K4L6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC27A3Q5K4L6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms