Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AB3PQ58FF7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms