Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDCA8Q53HL2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms