Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms