Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC57Q2TAC2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC57Q2TAC2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC57Q2TAC2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC57Q2TAC2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC57Q2TAC2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC57Q2TAC2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms