Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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SPHKAPQ2M3C7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPHKAPQ2M3C7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPHKAPQ2M3C7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPHKAPQ2M3C7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPHKAPQ2M3C7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPHKAPQ2M3C7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPHKAPQ2M3C7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPHKAPQ2M3C7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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