Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms