Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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