Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms