Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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