Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDB1Q16531 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDB1Q16531 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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