Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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