Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRF4Q15306 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRF4Q15306 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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