Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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