Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAM2Q15035 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAM2Q15035 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms