Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERC3Q15034 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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