Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCLAFQ15004 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCLAFQ15004 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms