Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RFTN1Q14699 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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