Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GINS1Q14691 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GINS1Q14691 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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