Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF4GQ14541 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms