Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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