Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE1CQ14123 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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