Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP1Q13835 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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