Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FHL3Q13643 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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