Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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