Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms