Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF4BQ13523 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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