Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BFSP2Q13515 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms