Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PICALMQ13492 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PICALMQ13492 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms