Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LCP2Q13094 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms