Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKRN3Q13064 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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