Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRDNQ13061 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms