Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GRIK3Q13003 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIK3Q13003 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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