Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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FOXD4Q12950 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXD4Q12950 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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