Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNTN1Q12860 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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CNTN1Q12860 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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