Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ST3GAL4Q11206 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms