Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
CPSF1Q10570 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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