Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBBP4Q09028 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms