Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE4CQ08493 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4CQ08493 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms