Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms