Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EGR4Q05215 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms