Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRB3Q04118 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB3Q04118 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms