Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTUD4Q01804 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms