Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA6Q01524 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms