Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTCQ00610 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTCQ00610 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms