Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDLBPQ00341 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDLBPQ00341 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms